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Die Forschung der medizinischen Fakultät wird geprägt durch die Konzentration auf interdisziplinäre, national wie international wettbewerbsfähige Forschungsschwerpunkte. Diese Schwerpunkte bilden vor allem die Neurowissenschaften, Onkologie und Immunologie, Infektionsbiologie und vaskuläre Medizin mit Diabetes-Forschung. Innovative Medizintechnik bildet einen verbindenden Querschnittsbereich zwischen den Schwerpunkten, genauso wie interne Core Facilities bzw. interdisziplinär agierende Forschungsverbünde (Sonderforschungsbereiche, klinische Forschergruppen und Forschungszentren). Darüber hinaus sind in zahlreichen klinischen Abteilungen selbstständige Forschungssektionen integriert.