CeGaT GmbH

Die Dienstleistungen der CeGaT umfassen die Sequenzierung von DNA und RNA von Menschen, Tieren, Pflanzen und Mikroorganismen:

Next-Generation-Sequencing
CeGaT wendet die SOLiD 4 und SOLiD 5500xl Technologie für Next-Generation-Sequencing an. Next-Generation-Sequencing ermöglicht Analysetiefe und Schnelligkeit bei geringen Kosten pro Base; es können bis zu 180 Giga-Basen pro Lauf erzeugt werden.
Die CeGaT GmbH ist seit ihrer Gründung offizieller Service Provider von Applied Biosystems / life technologies. Sequenziert werden Exome, Transcriptome, Epigenome, microRNA oder auch vollständige Genome. Bei Bedarf wird auch die vollständige bioinformatorische Auswertung der Daten durchgeführt.

DNA-Diagnostik
Die CeGaT bietet im Rahmen der DNA-Diagnostik die Sequenzierung und Interpretation aller beim Menschen als krankheitsverursachend bekannten Gene an. Die Ergebnisse werden dem einsendenden Arzt in Form eines Befundes mitgeteilt. Die Sequenzierung erfolgt auf einem 96-Kapillar- Sequenziergerät.

Diagnostik-Panels
Bei rund 80-90% der klinisch diagnostizierten, komplexen genetischen Krankheiten wird heute die ursächliche Gen-Variation nicht gefunden. Deshalb hat die CeGaT in Zusammenarbeit mit klinischen Partnern Diagnostik-Panels entwickelt. Mittels dieser Panels können sämtliche für eine Krankheit in Betracht kommenden Gene gleichzeitig mit dem SOLiD System sequenziert werden. Alle gefundenen Sequenz-Varianten werden auf dem Kapillar-Sequenzierer validiert. Erst danach werden die Daten interpretiert und ein medizinischer Befund erstellt.

Momentan werden 32 unterschiedliche Diagnostik-Panels angeboten:
• Demenz und ALS (1 Panel -20 Gene)
• Parkinson (1 Panel - 16 Gene)
• Epilepsie und Stoffwechsel (15 Panels - 265 Gene)
• Erbliche Augenerkrankungen (15 Panels - 196 Gene)
• Neuromuskuläre Erkrankungen (ca. 150 Gene – Einführung Q2 2011)

FISH-Assays
CeGaT bietet die Entwicklung von FISH (Fluoreszenz in-situ Hybridisierung) Assays zum Nachweis von Gen-Amplifikationen, -Deletionen und -Translokationen für nahezu jeden Genlocus, zugeschnitten auf den jeweiligen Bedarf an.

Weitere Informationen in den Fachportalen der BIOPRO Baden-Württemberg: